Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SacsQ9JLC8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SacsQ9JLC8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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