Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a3Q9JKZ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms