Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx5Q9JKQ4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms