Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap4m1Q9JKC7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap4m1Q9JKC7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap4m1Q9JKC7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms