Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdk2Q9JK42 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdk2Q9JK42 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms