Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfhx4Q9JJN2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfhx4Q9JJN2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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