Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip1Q9JJ57 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnip1Q9JJ57 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms