Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms