Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pus3Q9JI38 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms