Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtaQ9JHK4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms