Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tm9sf3Q9ET30 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Tm9sf3Q9ET30 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Tm9sf3Q9ET30 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tm9sf3Q9ET30 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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