Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lima1Q9ERG0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lima1Q9ERG0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms