Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rapgef4Q9EQZ6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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