Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQP2

Ehd4, EH domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd4Q9EQP2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ehd4Q9EQP2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ehd4Q9EQP2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ehd4Q9EQP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms