Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r44Q9EQ47 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms