Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eif3fQ9DCH4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms