Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc107Q9DCC3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc107Q9DCC3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms