Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmg20aQ9DC33 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmg20aQ9DC33 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms