Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkar1aQ9DBC7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1aQ9DBC7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1aQ9DBC7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkar1aQ9DBC7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms