Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Smg9Q9DB90 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Smg9Q9DB90 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smg9Q9DB90 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Smg9Q9DB90 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Smg9Q9DB90 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg9Q9DB90 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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