Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap1s2Q9DB50 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap1s2Q9DB50 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms