Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem38bQ9DAV9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem38bQ9DAV9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms