Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrmuQ9DAT5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms