Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9DA42 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9DA42 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9DA42 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9DA42 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9DA42 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9DA42 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9DA42 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9DA42 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9DA42 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9DA42 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms