Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q3

1700034I23Rik, RIKEN cDNA 1700034I23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034I23RikQ9D9Q3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700034I23RikQ9D9Q3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700034I23RikQ9D9Q3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms