Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnot8Q9D8X5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot8Q9D8X5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms