Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8N1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9D8N1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms