Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc91Q9D8L5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc91Q9D8L5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms