Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl4Q9D8E6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms