Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmigd1Q9D7L8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms