Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf13Q9D777 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13Q9D777 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms