Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptp4a3Q9D658 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptp4a3Q9D658 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms