Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam227bQ9D518 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam227bQ9D518 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms