Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tomm20lQ9D4V6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms