Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms