Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms