Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sohlh2Q9D489 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sohlh2Q9D489 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms