Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhc2Q9D485 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhc2Q9D485 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms