Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms