Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag1Q9D3E6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms