Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P0

Mrpl13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl13Q9D1P0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl13Q9D1P0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl13Q9D1P0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl13Q9D1P0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl13Q9D1P0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl13Q9D1P0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl13Q9D1P0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl13Q9D1P0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms