Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syf2Q9D198 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms