Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem53Q9D0Z3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms