Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms