Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmss1Q9CZT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmss1Q9CZT6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms