Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm8Q9CZR4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms