Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms