Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx7Q9CY18 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx7Q9CY18 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms