Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prdm5Q9CXE0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm5Q9CXE0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms