Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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